L’acte de consécration de l’église de St. Quirze l’an 935, “Vallen quam vocant Colera”est le premier document connu où apparaît le toponyme “Colera”. Lors de l’octroi de francs-alleux par le Comte Guspert d’Empuries au monastère de St Quirze, l’an 931, “la vall de Colera” (la vallée de Colera) fut alors appelée “Valle de Collera”.


Le toponyme Colera, provient probablement du latin COLLIS, Coll, ( col, crête). Le 4 Février 1769, Isidre Ferran Sangenís, u n paysan de Garriguella, et ses deux frères Ramon et Josep Sangenís sollicitèrent du roi Carles III l’autorisation de construire 50 maisons sur des terrains de leur propriété pour accueillir sa population correspondante. Ainsi fut fondée la nouvelle “vila” de Colera.(Vila est le nom que l’on donne à une agglomération qui, sans avoir le titre de ville possède certains privilèges). Le 4 Juillet 1770, la réponse du roi donnant l’autorisation de construire arriva. Le nouveau village s’appellera San Miguel de Colera.


Il semblerait que l’autorisation de la construction de la nouvelle “vila” ait été accompagnée d’un plan qui aurait indiqué de quelle façon devait être construit le nouveau village : où devait se situer l’église, la mairie, les canons de défense, etc., bien qu’il n’y ait jamais eu de document réel à l’appui, d’autres documents sembleraient indiquer qu’il en fut ainsi.


A la demande des habitants de Pòrtbou i Molinars, la Diputació de Girona, en date du 10 Avril 1885 édicta un arrêté relatif à la commune de St Miguel de Colera qui décida le rattachement de celle-ci à la commune de Portbou. Le 23 Mai 1885, les habitants de Colera en désaccord avec cet arrêté brûlèrent les archives de la mairie et le lendemain, 24 Mai, lors de la séance plénière qui se célébra à la mairie de Portbou le titre de capitale fut accordé à Portbou au dépend de Colera.


La loi signée le 2 Juillet 1934 par le Président de la Generalitat de Catalunya, Lluis Company, autorisa la scission de Colera de la commune de Portbou.